BioXM是Windows平台上的序列分析软件,支持DNA以及蛋白质序列全套基础分析、精准计算蛋白分子量、多序列比对,可一站式搞定各类分子生物学基础研究。内置专业的酶切位点分析、PCR引物设计、Tm值计算、载体序列去除功能,完美适配分子克隆、PCR实验前期预判工作,大幅降低实验失误率。
BioXM官方版集成ClustalW多序列比对、双序列比对、SSR位点检索等实用功能,支持FASTA等主流序列格式转换与排版,分析结果可直接导出、复制或打印。
1、DNA序列分析
2、蛋白质序列分析
3、多序列比对
4、氨基酸相似性计算
5、酶切位点分析
6、ORF分析
7、分子量和
8、电点预测
9、序列数据库
Q1、输入DNA序列BioXM似乎不能正确识别?
A:这是因为BioXM默认打开的是氨基酸序列,您可以在菜单中选择“序列整理”命令。
Q2、序列窗口中的序列容易混淆,怎么办?
A:鼠标双击序列窗口可以更改序列标签名,使您不会混淆各窗口。
Q3、每次输入DNA序列总是保留其他非法序列怎么办?
A:您可以在选项中打开强制识别序列为DNA,这样就会祛除其他非法序列。但是如果您要打开氨基酸序列,必须关闭此项目。
Q4、如何才能快速了解新版本BioXM的特色?
A:打开帮助→更新记录→可以使您快速了解新版本BioXM的特色。
Q5、我想编辑序列,该如何做?
A:如果您要编辑序列或更改序列颜色,可以关闭工具栏中的“是否允许序列自动格式化”图标。
Q6、查找SSR时好象有所遗漏?
A:其实这并不是BioXM的错误,考虑到相近的SSR有可能是相同的(至少非常相似),我们设置了两个重叠SSR之间的距离,将其设置的小一些可能会出现更多的彼此靠近的SSR。
Q7、我运行BioXM总是忘记了时间怎么办?
A:不要紧,您可以在选项中打开“提醒打开BioXM时间”选项卡,这样每过1个小时,BioXM就会自动提醒您。
Q8、窗口数目太少,怎么办?
A: 在工具→选项→序列窗口,中可以更改窗口出现的数目和背景色。
v2.7.1版本
1、在工具中增加了PubMED文献检索功能,不知是否实用;
2、修正了序列查找错误自动退出的错误;
3、修正了定位序列,窗口显示位置的错误;
4、收藏夹增加了部分small RNA分析的网址。
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